文字撰稿：新聞中心
圖片來源：中央流行疫情指揮中心直播記者會
中央流行疫情指揮中心6月1日公布新增88,247例本土病例，個案分布以新北市最多，其次依序為台中、高雄、桃園、台南、台北。指揮官陳時中表示，全台染疫率目前為8%，新北染疫率已達15%、16%，幾個染疫率較高的縣市目前已呈下降趨勢，高雄等幾個染疫率低的縣市還在往上走，全台疫情可能會在高原期徘徊一陣子。他預估全台染疫率達10%後，疫情就會緩步下降。
另外公佈死亡個案122例、重症個案240例。死亡個案中2例為嬰兒，分別是1個月大的男嬰與5個月大的女嬰，皆於家中死亡後才確診，1個月大的男嬰也是本土疫情年紀最小的死亡個案；累計至今，這波疫情共造成12名兒童死亡。
指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞指出，1個月大的男嬰早產出生後患有肺部疾病，因有2位同住家人確診，5月24日開始發燒，25日上午昏迷缺氧、全身發紫，警方協助就醫，到院後確認無生命跡象，PCR採檢陽性，經司法相驗，開立死亡診斷書，死因為呼吸衰竭與新冠病毒感染。
另一名死亡嬰兒為5個月大印尼籍女嬰，家長也是印尼籍。5月14日女嬰發燒至38度但未就醫，當天快篩陽性，隔日昏迷無反應、全身發紫，照顧者送醫救治，到院時無生命徵象，經司法相驗為感染新冠病毒，另開立行政相驗診斷書為新冠肺炎合併心肺衰竭。
此外1日新增1例兒童重症為1名9歲男童。本身無慢性病，5月29日發燒至39、40度，於家中快篩陽性，向衛生所通報後看診、開立藥物，返家後出現抽搐、意識變化，緊急送急診，懷疑為腦炎，收治住院後，使用瑞德西韋、類固醇、抗癲癇等藥物治療，目前在一般病房治療，未使用氧氣，生命徵象穩定。
累計至今，兒童重症共有29例，其中15例腦炎、6例肺炎、2例敗血症、2例哮吼、1例共病(腦腫瘤)、3例家中死亡。兒童腦炎個案累計共有15例，其中5例死亡，另外10例腦炎重症個案病況都已改善。
為避免疫情擴散，目前全台14縣市宣布學校或高中以下遠距教學再延長一周至6月10日，包括苗栗、台中、彰化、南投、雲林、台南、宜蘭、澎湖、台東、連江；嘉義、屏東則延長至6月12日。台北市因小學生6月3日前接種兒童疫苗完畢，國高中、小學及幼兒園學童6月6日當周正式回復實體上課。
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